行政办公室是北京脑所的信息枢纽、部门协调的综合性行政管理部门，负责研究所日常运转工作，筹备安排研究所各种行政会议，协调参与重大活动的组织；负责研究所制度及信息化建设工作；负责印信、文电、机要、档案工作；负责研究所人才服务保障工作；负责党支部建设及日常管理；负责突发事件的应急处理。

科研事务部是北京脑所行政团队中负责对外科研合作交流、对内科研服务管理的部门。以研究所“小核心、大网络”的运行机制和四级合作网络的对接服务为工作主线，面向国内外科研合作机构、在京共建单位、专家委员会、研究所内部实验室开展科研合作对接、学术交流组织、科研规划、项目管理、国家“脑计划”对接、知识产权及成果转化管理等服务工作。

教务部是负责研究所研究生招生、博士后招收与培养工作的管理职能部门。全面组织实施研究生招生工作，协助开展导师遴选相关工作，统筹全所研究生开题、中期考核、学位论文答辩等培养管理工作；承担学生日常教学、学风建设、评奖评优、考勤管理与心理健康教育服务等相关事务，并负责博士后招收进站、在站培养、科研支持与出站管理。同时围绕师生科研、学习与生活需求开展组织协调与服务保障，全力保障科研与学业有序推进，持续助力研究所人才培养质量与核心竞争力不断提升。

人力资源部聚焦人才服务、人事管理与工会建设三大核心工作主线，负责研究所的人才队伍建设与组织效能提升工作。部门紧密围绕研究所整体发展战略与阶段性目标，秉持“以人为本”的工作理念，致力于构建高效、专业、富有活力的人才服务体系。在人才引进、培养与发展过程中，我们不断优化工作机制，强化服务保障，努力实现“引得进、留得住、用得好”的人才管理目标。同时，通过完善规章制度、优化组织流程、加强员工关怀，不断提升研究所的组织凝聚力，助力科研工作的高效推进与可持续发展。

维护保障部是研究所行政团队中负责基础建设和运营保障的服务部门。部门员工承担研究所实验室的运营保障工作：负责研究所实验大楼配电室、洁净空调、新风系统、空调系统等设备设施的24小时不间断运行管理和维护保障工作。

设备管理部负责研究所科研物资采购管理、资产管理、实验室安全管理，以及研究所职能管理委员会赋予的日常管理工作。包括大额科研物资集中采购、实验室管控品采购和管理，指导实验室采购工作，以及物资进口的监管、减免税及其后期管理等；实验室安全管理（含生物安全），安全教育培训，科研用特种设备监管，以及实验室改造的安全审核工作等；资产核定、清查和处置的管理。

财务部是研究所负责会计核算、税务管理、财务信息分析以及配合协调审计工作的职能部门。贯彻执行国家财政法规及内部财务规章制度，建立健全会计核算、监督及内控管理体系。统筹编制研究所预算、决算及年度财务报告。承担科研经费相关管理工作。推进财务信息化升级建设，构建智能财务系统。通过业财深度协同、智能技术赋能、风险精准防控三位一体的管理策略，持续优化资源配置效率，强化财务战略支撑功能，为研究所高质量发展提供决策支持与价值创造双重保障。

网络信息化办公室主要负责贯彻落实有关网络安全和信息化建设的政策、法规和标准；负责信息化相关项目的管理、协调与实施工作；负责信息化统筹公共基础设施与系统建设、管理与维护；负责信息安全体系规划与建设，信息安全防护及安全教育工作；负责实验室及平台站群网站的设计、建设与维护；负责科研制图，内部标志标识设计以及桌面支持等相关工作。